好氧呼吸必须有分子氧参加才能进行，因此要有优秀的通气条件。好氧微生物有完整的酶系统呼吸过有脱氢酶、氧化酶、细胞色素的参加，分子氣是最终的电子受体。营养物质中的氢被脱氢酶活化后，从基质中脱出来交给递氢体并且放出电。氧化酶行使放出的电子激活游离氧，活化氧与基质中脱出的氢结合成水并放出能量。
    厌氧呼吸作用是在无分子氧的状况下进行的，因此它必然是一个缺氣的环境。进行厌氧呼吸的微生物只有脱氡酶系统，而没有氧化酶和细胞色素，分子氧对其有克制作用。在厌氧呼吸中，基质中的氢被脱酶激活后通过递氢体传递给氧以外的有机物或无机物使其还原。
    敞开式的循环冷却水系统始终饱和着消融氧，只有消融水的铒微牛物才能行使，这恰好知足了好氧微生物的生氏要求，污泥腐蚀产物堆积处是缺氧环境，为厌氧微牛物的卞长提供了条件。